| Exemple |
Dans cet exemple, nous vous proposons de créer un fichier au format gaussian comprenant l'étude d'une
molécule d'eau à l'aide de gaussview, puis de soumettre le fichier à gaussian et enfin de
lire les résultats via gaussview :
- Création d'un fichier au format gaussian avec gaussview :
Lancez gaussview comme indiqué ci-dessus.
Pour construire la molécule d'eau, cliquez sur le bouton "Element" de la fenêtre "Builder", puis sur "O".
Puis nettoyez la structure en cliquant sur le bouton "Clean" de "Builder".
Ensuite sauvez la structure au format gaussian en sélectionnant le menu
"File->Save File", avec comme type de fichier : gaussian et nommez
le fichier h2o.com.
Vous pouvez modifier h2o.com directement depuis gaussiew en sélectionnant le menu "Calculate->Gaussian".
La fenêtre "Gaussian Calculation Setup" apparaît. Modifiez "title" en "h2o hf/3-21g frequencies" et choisissez
le type de job : "Frequency" puis "No Raman intensities".
Finalement cliquez sur "Edit...", puis "Save", "OK" et "Overwrite".
Voici le fichier h2o.com généré par gaussview :
%chk=h2o.chk
%nproc=1
%mem=4MW
#p freq=noraman rhf/3-21g geom=connectivity
h2o hf/3-21g frequencies
0 1
O
H 1 B1
H 1 B2 2 A1
B1 0.960000
B2 0.960000
A1 109.471221
1 2 1.0 3 1.0
2
3
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- Soumettre le fichier à gaussian :
Pour des jobs dont l'exécution est supérieure à 30 min, vous devez utiliser le loadleveler.
Pour l'exemple ci-dessus nous lancerons l'exécution en intéractif (n'oubliez pas d'initialiser les
variables d'environnement de gaussian):
g09 < h2o.com > h2o.log
- Consulter les résultats avec gaussview
Lancez gaussview et ouvrez le fichier h2o.log dans le menu "File->Open" dont le type est .log.
Puis sélectionnez le menu "Results->Summary", ou
"Results->Charges" ou "Results->Vibrations" ou "Results->View
File".
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